女性尿道口囊肿是否严重与囊肿的大小有很大关系。如果囊肿的体积较小，一般不会引起任何临床症状，也不会影响到女性正常的排尿。
如果囊肿体积较大，可能会压迫到尿道或者是引起尿道梗阻，在严重时甚至会导致急慢性的尿潴留。此外，体积较大的囊肿很有可能会出现破溃、出血，或者是感染。感染还有可能经尿道逆行，引起尿路感染疾病。
因此，对于体积较大的尿道口囊肿应及时的进行手术切除。如果存在感染，在术后还需要进行抗感染治疗。在术后，大多数患者预后较好，复发率较低。