急性间质性肾炎可由多种原因引起。
它的鉴别诊断可以通过病史的采集，看是否存在近期感染病史和证据，是否有使用可疑药物的病史，近期是否有过毒物接触史和放射照射史。可以通过查体和实验室检查，发现是否存在全身过敏性表现，是否存在免疫学指标的异常，是否存在血钙、尿酸等代谢异常。必要时可以通过特殊的检查手段(如肿瘤相关抗原检测、骨髓检查等)除外肿瘤相关性急性间质性肾炎的可能。而对于那些肾组织病理改变为急性间质性肾炎，但临床无特异性病因可寻时，可以诊断为特发性急性间质性肾炎。