一般情况下，HPV疫苗不会造成接种者心律不齐。个别女性由于自身体质特殊，对HPV疫苗的成分过敏时，可能会出现心跳加速等心律不齐的现象。
导致心律不齐的原因有很多，有生理性原因，也有病理性原因。生理性原因，比如情绪激动、心理紧张、剧烈运动等，都可能会引起心跳加速、心率加快等心律不齐的现象，经过好好休息、心情平静放松后，心律很快就会恢复正常。病理性心律不齐的原因，主要是心脏疾病引起的。
HPV疫苗的主要作用是预防女性宫颈遭受人乳头瘤病毒的感染，降低女性宫颈癌的发病率的作用。大部分人接种HPV疫苗后，不会出现不适症状，只有少部分人出现头晕、乏力、恶心、呕吐、接种部位红肿、硬结等症状，这些症状比较轻微，属于疫苗接种副反应，是正常现象，2~3天后会逐渐消失，不需特殊处理。
接种HPV疫苗后，应该就地观察30分钟，如果有心律不齐等症状，应该及时与医生沟通。