胸内甲状腺囊肿是甲状腺激素分泌过少，甲状腺的功能变低，进而机体为克服甲状腺功能变低，导致胸内甲状腺囊肿。
还有可能是甲状腺动脉缺血缺氧，使小动脉收缩，随之出现了扩血管物质，导致甲状腺动脉扩张，使血管渗透压增大，炎症物质的渗出，组织液回流受阻，而使胸内的甲状腺出现囊肿。
首先要进行消炎处理，最快有效的方法是服用一些抗炎药物。其次是直接服用甲状腺激素的方法，使甲状腺囊肿回缩，甲状腺变小，恢复甲状腺的功能，降低甲状腺的负荷，便于机体处于一个相对流通的状态，对于机体是一个有利的方式。