包虫病是不能够做穿刺诊断的。因为一旦穿刺，会出现囊液外溢，囊液外溢后患者会出现反应性的胸膜炎、腹膜炎、过敏反应，并且棘球蚴破溃到胸腔、腹腔，会导致播散种植，出现继发性棘球蚴病。严重时患者出现过敏反应而导致过敏性休克，危及生命。
对于疑似有肝包虫病的患者，在诊断方面可以采用免疫学检查，包括皮内试验、血清免疫学试验等方法。
皮内试验操作简便、快速，阳性率达到90%，可以作为初筛试验。对于血清免疫学试验，阳性率较高，可以作为筛查试验的重要诊断方法。