半夜会腰疼的情况一般都和白天的扭伤、劳累、受凉、炎症物质渗出有关系。白天因为各种事物繁杂精力分散，可能不太注意，夜晚精力会比较集中在疼痛的部位，并且白天夜晚的交感神经、副交感神经兴奋程度也不同。
同时在夜晚睡觉时，受伤的肌肉会持续的渗出、僵硬粘连、乳酸堆积。如果比较重，在休息以后不能缓解，就会出现腰疼不适的情况，有些炎症和局部的刺激也会在夜晚加重。一些胃肠道的疾病、泌尿系的结石感染都会在局部引起腰部的疼痛和放射痛，这些都需要注意。
同时，半夜睡觉腰疼要注意有没有局部潮湿阴冷的环境，或者受凉刺激，或者床铺太软等，这些都会对脊柱腰部产生不良的影响，从而出现疼痛。