食物中毒以及肠胃炎的判断需要详细询问患者最近的饮食结构，因为二者之间在临床表现上会有所相同，但是食物中毒与进食某种食物有一定关系。如果其他患者进食该类食物也出现了同样的症状时，食物中毒的可能性较大。
同时食物中毒起病较急，并且是集体发病，潜伏期很短。如果是肠胃炎患者，一般不会集体发病，患者的恶心、呕吐、腹痛、腹胀以及肠胃炎症状没有食物中毒严重。
二者之间在处理上有很大的区别，食物中毒需要给予洗胃、灌肠，促进毒物的排出。