早晨醒来后口苦，可能与反流性食管炎、肝胆疾病等有关。反流性食管炎的患者，在夜间由于体位的关系会加重反流，胃内的胆汁、胃酸反流到口腔，聚集在口腔内，所以会导致起床后感觉口苦，做电子胃镜就可以确诊。需要给予抑酸药，例如奥美拉唑、泮托拉唑，以及曲美布汀促进胃的排空，减少反流，改善口苦。
也有可能是肝胆方面的疾病，例如胆囊炎、急慢性肝炎等，也会造成口苦的现象，需要给予清肝利胆、清热滋阴养胃的中药调理。
日常饮食要避免进食油腻、燥热、高脂肪类的食物，主要以清淡、优质的蛋白和高维生素食物进食为主。