导致睾丸萎缩的原因比较多，主要见于以下疾病：
引导下降固定术后，尤其是腹腔内等高位隐睾，青春期腮腺炎性睾丸炎等病毒性睾丸炎治疗后，睾丸扭转手术治疗后，精索血管损伤治疗后，青春期精索静脉曲张等。
睾丸萎缩主要是供应睾丸的动脉血供出现障碍，进而导致睾丸慢性缺血。睾丸组织得不到动脉的营养，从而出现睾丸逐渐变小萎缩。以上导致睾丸萎缩的原因当中，基本是一个长期慢性的过程，常常在发病几年，甚至数十年以后才出现以上的萎缩情况。