肛瘘是肛周脓肿未经治疗的后遗症。发生是因为内口未得到彻底解决，感染反复发作，从肛门周围皮肤上的外口反复的、淋漓不断的向外流脓，或者是脓血样物，甚至是流出粪便。
所以，肛瘘出血是正常现象，肛瘘严不严重，应该跟流脓液及脓血量多少有关。肛瘘加重代表着正处于急性炎症期，这时流脓多，常伴有臭味，引流不通畅，脓液淤积可能再次诱发肛周脓肿。
慢性炎症期时流脓少，时有时无，流出来的脓汁稀淡，或成米泔样分泌物，外口有时可愈合。要想治愈肛瘘，关键还是得将内口找到，并处理好，如进行挂线治疗手术等。