肛瘘和肛裂哪个最严重，应该看这两种疾病的病情严重程度如何。
肛瘘是一种感染性疾病，临床上分不同的时期，具体为静止期、慢性感染期、急性感染发作期。如果患者处在静止期或慢性感染期，肛门处一般无明显疼痛的感觉。但如果处于急性感染发作期，患者肛门周围会感到疼痛不适，同时还有可能伴随着发热等全身症状。
肛裂是由于肛管下端的皮肤出现了裂口，并发生溃疡导致的，新鲜肛裂时患者仅是在排便时有轻微的疼痛感。但如果进展成陈旧性的肛裂，患者会出现肛门周围剧烈疼痛。所以，要想比较这两种疾病哪个更严重，必须分阶段来看，不能一概而论。