大脚趾甲凹凸不平，往往是下列几种原因造成：
1.灰指甲。此病是因为皮肤癣菌侵犯到了甲板或者甲床造成，会使甲板变得浑浊、增厚、分离。有的患者甲板可能会变脆、变色，甚至脱落、翘起，或者表面凹凸不平、钩甲等。
2.体内缺乏营养元素造成。尤其是缺乏维生素时，容易使脚趾甲营养不良，主要表现为凹凸不平等。也有可能是缺乏微量元素，比如锌等，引起凹凸不平。
3.甲沟炎造成。与细菌感染等有一定关系，会使大脚趾甲凹凸不平。