肝脓肿如果治疗的不及时，到了晚期会出现很严重的症状，比如会发展为肝功能衰竭，出现腹痛、高热甚至腹膜炎。病人会有黄疸，精神状况差，食欲下降，无法进食。
严重的脓肿破裂会引起腹膜炎，不仅上腹部疼痛，整个腹部也会疼痛。这样的病人很难摆脱高烧，吃药和输液都不能解决问题。
由于脓肿后期，大量毒素进入血液，引起全身炎症反应，对患者的肝肾功能有很大影响，患者非常危险。因此，肝脓肿晚期患者若不及时行引流手术，将危及生命。