在临床上单个外口或者痿管只有一条的称之为单纯性肛瘘，而多个外口或者多根瘘管，就称为复杂性肛瘘。
有些瘘管过长或者弯曲，在临床上也可以称为复杂性肛瘘。复杂性肛瘘有时是单内口，有时是多内口，这个需要在术前检查明确内口的位置以及数量，复杂性肛瘘，也需要行手术治疗。
症状和肛瘘是一样的，也会出现反复的肛周流脓以及肿痛，肛门周围会有多个外口，都会有流脓感染症状。所以患者一旦明确复杂性肛瘘，还是应该及时行手术治疗。