生理性的黄体囊肿，对怀孕一般是没有影响的。黄体囊肿的形成是因为卵子从卵巢排卵后，在卵巢表面有一破裂口，也叫排卵口，排卵口周围有血运，会有少许出血，但排卵口会很快的自然愈合。
排卵以后卵泡腔内的液体与出血液会融合在一起形成血体，继而血体转化为黄体。卵巢内的卵泡腔内的颗粒细胞及黄体细胞在激素水平作用下，黄体增大。
如果没有怀孕，黄体就会萎缩，月经来潮。但仍然有少部分的黄体囊肿没有萎缩，仍然存在，但一般经过2到3个月经周期后，黄体囊肿会自然萎缩，是不需要特殊处理。它是一种生理性囊肿，一般不会影响怀孕，如持续存在，可以予以口服避孕药处理后就会自然消失。