卵巢黄体囊肿对怀孕是有一定影响。但是这种影响是正面的影响，而非负面的影响。
卵巢黄体囊肿出现在卵巢排卵后，黄体功能达到最高峰的时候，在这个时期卵巢的黄体功能由于是最高峰，所释放的激素水平也是最多。如果女性成功受孕，卵巢黄体囊肿会继续维持释放较高的激素，来支撑妊娠继续下去。
因此，在临床上有种疾病叫做流产，其中一个常见的原因就是卵巢的黄体功能不全。对于卵巢黄体囊肿的女性，黄体囊肿只是从外形上看像是卵巢囊肿样的改变，而非真正的囊肿，因此不必过于担心。在妊娠进入到孕中期以后，黄体功能逐渐的被胎盘功能所替代，最终黄体囊肿自行消失，所以是正常生理现象。