如果经常拉肚子可能会引起肛瘘。因为本身肛肠类的疾病和饮食关系就比较密切，如果经常拉肚子会导致肛门局部感染的机会增加，从而产生肛周脓肿、炎性外痔、肛窦炎、肛瘘疾病。
尤其是本身就患有痔疮或周围有炎症的，经常腹泻会加重疾病。例如，如果有肛周脓肿，内口一般会在齿状线上肛窦处，当感染进一步加重脓肿可能会自行破溃或者在切开引流时会形成外口。在肛周皮肤上，外口一般生长的比较快，但是内口愈合的比较慢，通常是假性愈合。如果长期拉肚子会导致反复发作破溃，形成瘘管。
另外，如果经常拉肚子并且排便姿势不正确，会导致痔静脉回流不畅，也有可能会引发肛瘘。