母乳性黄疸出现的原因，目前尚未研究明确。但一般认为与以下因素有关系。首先是喂养方式。生后一周内纯母乳喂养的正常新生儿出现黄疸，血清胆红素超过传统的生理性黄疸标准值，可称为早发型的母乳性黄疸。其发病原因常与能量摄入不足、喂养频率及哺乳量少有关，发病机制以肠蠕动减少肠肝循环增加有关。第二种是母乳的成分。生后一周以上的纯母乳喂养正常新生儿出现黄疸，血胆红素超过传统的生理性黄疸标准值可称为晚发型的母乳性黄疸，其发病原因考虑与母乳中的β葡萄糖醛酸苷酶含量高，在肠道内通过水解结合胆红素成为未结合胆红素，使回吸收增加，导致了黄疸。第三种的话与肠道菌群有关。母乳喂养儿缺乏转化结合胆红素的菌群，使肠肝循环的负荷增大，导致黄疸的加重。