临床表现为非特异性，可能与胃炎、胃溃疡、胃癌相似，难以鉴别，X线检查对诊断无帮助。
虽然在呕吐物和胃内容物中常发现大量真菌，但由于胃内真菌病非常罕见，而且胃内容物中可能存在许多真菌的机会。没有一个报告的胃真菌病有正确的临床诊断，最终的诊断只取决于手术或活检。
为了避免患上此病，平时最好少吃油炸食品，因为这种食物不易消化，会增加消化道的负担。少吃腌制食品，这些食品含有较多的盐和一些致癌物质，不宜多吃。少吃生、冷食物刺激性食物，生冷食物具有较强的刺激作用。