肛裂手术后不容易出现后遗症。肛裂的手术后遗症在临床上出现的比例一般为1%~3%，最为严重的是损伤肛门直肠环和深部括约肌，造成肛门失禁，这是临床上最为严重的后遗症。
肛裂采取手术治疗，多见于陈旧性肛裂。手术方式主要是内括约肌纤维部分切断术、切开术、肛管皮肤移植术等。手术中如果解剖层次清晰、有条不紊，细致操作，出现后遗症的几率较低。
如果术中出现意外情况，手术医师仓促止血，解剖层次紊乱，则很容易造成括约肌的损伤，造成后遗症。