吞咽困难是食管梅毒最为常见的症状，多数是无痛性的。其特点是病程长、进展慢，与食管癌不同。当疾病进展时，喂养液也可能有吞咽困难和胸骨后压迫，导致体重减轻、脱水、贫血甚至恶病质。一旦牙龈样肿胀导致气管食管瘘，每次进食都会发生窒息。
此外，还可能出现其他食管炎和梗阻症状。食管梅毒的诊断依据病史、实验室检查、X线、内镜活检。X线表现为管壁僵硬、管腔狭窄，甚至阻塞，与肿瘤难以鉴别。内镜检查的结果取决于病程和病情的严重程度。食管粘膜通常充血、水肿、糜烂、溃疡。有时，可以看到白色斑块。