咽拭子检测采集时会有一定的不适，如出现咽痛、恶心，甚至呕吐等症状，但通常标本采集完后立即缓解，或经过休息及适当饮用温开水后即可好转，因此做咽拭子标本采集时不要有心理压力。
为减少咽拭子检测采集标本时出现的咽痛、恶心、呕吐等症状，建议患者标本采集前两小时不要进食和喝水，以免因为呕吐造成误吸甚至窒息。标本采集前可以适当的对患者进行心理安慰，以缓解患者的紧张情绪，取得患者的配合，也能在一定程度上缓解患者的不适。