半蹲膝盖疼考虑以下几种原因：
1.髌骨软化症。髌骨关节面发生退变，软骨磨损，当半蹲的时候，髌骨与股骨关节摩擦，发生疼痛，有的还会有响声。通过股四头肌锻炼，症状可以改善。
2.半月板损伤。通常是因为关节外伤造成，当半蹲的时候，半月板卡在关节间隙，引起疼痛，严重会发生嵌顿。
3.骨关节炎。当关节退变、增生、软骨变薄后，关节磨损增大，半蹲的时候，骨和骨碰撞，发生疼痛。
所以，半蹲疼痛说明关节发生了严重病变，需要拍片确定后，尽早处理。