蹲着膝盖疼如果为年轻人，可能是膝关节内软组织损伤如半月板或交叉韧带损伤所导致。
如果年轻人在进行一些体育运动时，用力过大可能会导致膝关节部位的韧带或半月板损伤，在下蹲时会对损伤的部位造成刺激，就会引起膝盖疼痛的症状。如果是轻度的损伤，主要是进行保守治疗，比如药物治疗或者物理治疗。如果受损较严重，还应当考虑手术治疗。
如果老年人出现了蹲着膝盖疼痛的症状，可能是膝关节骨性关节炎，大多与关节软骨退变有关。在下蹲时，由于膝关节压力急剧上升会使关节负荷增大，炎性物质会增多就会导致膝盖疼痛。