患有脑炎的病人，如果没有及早地发现，积极地治疗或者比较严重的病人，有可能会留下后遗症。可能会有言语迟钝、失语、吞咽困难、表情淡漠、头痛、呕吐、哭笑无常、瘫痪等后遗症，有的病人可能会导致癫痫、脑萎缩、脑积水等后遗症。
脑炎是比较严重的疾病，一旦确定患有脑炎，应该查明具体的病因以后，进行对因治疗并且配合营养支持疗法治疗和对症治疗。
尽早的治疗，通常可以收到比较好的疗效，有利于防止并发症。如果留下了后遗症，通常需要较长时间的治疗和恢复。