化脓性关节炎和急性骨髓炎都属于骨质或者骨质的结构产生了细菌的感染，产生感染性的疾病。化脓性关节炎就是指关节内出现化脓菌的感染，产生一系列的病理改变症状和体征。
急性骨髓炎一般是指除关节以外的骨质、骨膜以及骨髓出现感染性的炎症导致的，二者的病变部位是不同的。但是如果急性骨髓炎炎症比较严重，控制不利，炎症会通过干骺端侵入到关节内，也可以导致出现化脓性的关节炎。所以，二者一般是以病变部位来界定的。
原因和病理改变都是以化脓性炎症为主。化脓性关节炎早期是以关节内的滑膜病变为主，然后会侵袭到关节软骨，最终会侵袭关节的骨质。急性骨髓炎一般都是从骨组织的破坏感染开始的。