胰腺癌和自身免疫性胰腺炎都是危害性严重的疾病，但两者的恶性程度不同，胰腺癌是可怕的癌症，最终危及到患者的性命。
区别有症状不同：自身免疫性胰腺炎没有特异性的症状，胰腺癌患者的上腹部感觉到饱胀不适，而且疼痛症状特别明显。
病因不同：自身免疫性胰腺炎的发病原因是有待阐明的，胰腺癌的起因有很多，比如生活因素，长时间吸烟或是喝酒等，另外还有环境污染等。
治疗方法不同：自身免疫性胰腺炎的治疗工作，多采用激素治疗，胰腺癌早期以手术治疗为主。