潜伏期比较短，常用于进食后数小时发病，沙门菌有时可达2到3日。主要表现为不同程度的中上腹部持续性或者是阵发性的绞痛、呕吐、腹泻等，可有畏寒发热、头痛乏力、脱水酸中毒和休克等表现。
金葡菌和蜡样芽孢杆菌食物中毒时，呕吐尤为剧烈，呕吐可乘胆汁性可带有血液或是粘液，腹泻，每日数次至十余次不等，多为黄色稀便水样便或者是粘液变。鼠伤寒沙门菌食物中毒时，粪便具有腥臭味有时可见脓血便。
食物中毒可成非出血性腹泻出血性的肠炎溶、血性尿毒症、综合症等不同的表现，副溶血弧菌食物中毒常可出现血性腹泻，病程多在1到3日。金葡菌和蜡样芽孢杆菌食物中毒，并成数小时至1到2日沙门菌食物中毒，并成3到5日，偶尔可达一到2周，出血性肠炎多在7日内恢复。