百日咳与支气管炎是有一些区别的：百日咳由百日咳杆菌引起的呼吸道传染性疾病，有较强的传染性。百日咳特征为出现阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽剧烈时可以出现吸气末的鸡鸣样声，百日咳的病程多在2~3个月。
支气管炎可分为急性支气管炎和慢性支气管炎2种，支气管炎多数是由病毒、不典型病原体和细菌感染导致的，一般来说传染性很小，支气管炎的发病主要与患者的抵抗力下降有关。
支气管炎的主要症状多为咳嗽、咳痰、发热，急性支气管炎的病程在1周左右。慢性支气管炎中老年发病为多，表现为慢性的咳嗽、咳痰，合并急性加重时会出现咳嗽、咳痰增多。