儿童急性肠胃炎，其治疗的原则与成人基本上一致。首先要根据发病的原因分辨出感染性还是非感染性肠炎，也要依据病原菌，找到敏感的抗生素，排除因为放射治疗引起的肠炎。
急性期病人应该禁饮食，及时采用肠外营养，纠正水电解质紊乱和酸碱平衡失调。补充各种维生素和微量元素，注意休息。
在病程逐渐进入慢性期或者缓解期，及时给予肠内营养，给予高热量、高蛋白高纤维素、少渣和少刺激性的饮食。如果出现肠坏死、肠穿孔等，要及时的手术治疗。