肛周脓肿一般采取一次性根治术，术后复发的概率就比较低。
目前一次性根治术是治疗肛周脓肿的主要手术方式。一次性根治术在将脓肿切开引流的同时，需要对脓腔以及内口进行探查，并且准确地找到内口，将内口一并切开。这样就可以通过一次手术就治愈肛周脓肿，避免肛周脓肿后期发展成为肛瘘而需要二次手术。但在探查寻找内口的时候，应避免粗暴用力，以免造成假性内口而增加后期治疗的难度。
肛周脓肿一次性根治术相对于肛周脓肿切开引流术，对医生临床经验要求更加高。所以建议患者找有经验的肛肠外科医生就诊、手术。