大多数自身免疫性胰腺炎患者需要激素治疗，这也是有效的。常用强的松治疗，可根据体重选择初始剂量，1-2个月后，根据患者的治疗反应，适当减少。
对于维持治疗的持续时间没有一致意见，根据病情活动和激素相关不良反应，可选择1～3年。一些自身免疫性胰腺炎患者在激素减少或停药后可能复发，再次使用仍然有效。
对于年老体弱的患者，如果对糖皮质激素的应用有顾虑，可以对症治疗，如梗阻性黄疸的内镜下支架置入术等。对糖皮质激素治疗无效的患者，应重新评估诊断，并考虑手术探查。