卵巢囊肿一般不会引起胎停。如果卵巢囊肿不影响正常排卵，卵子和精子可以正常结合形成受精卵，从而形成胚胎。
引起胎停的原因主要是胚胎染色体异常，导致不能继续发育，此外子宫发育畸形、子宫内膜薄、子宫感染也会导致胎停。母体患全身性疾病，如高血压、糖尿病、慢性肾炎、系统性红斑狼疮、重度贫血等，都会引起胎停。免疫排斥、接触有毒、有害物质、接触放射性物质也会引起胎停。不良的生活习惯，如过度吸烟、酗酒等也与胎停有关系。
卵巢囊肿虽然不会引起胎停，但是卵巢囊肿过大可能会在孕期发生破裂，对妊娠产生不良影响。