卵巢囊肿是有可能引起月经不调的，单纯的卵巢囊肿如果直径小于5厘米，没有什么症状的话不会引起月经不调，但是如果是卵巢功能性囊肿，例如黄体囊肿或者卵巢巧克力囊肿，是会引起月经不调的，尤其是卵巢巧克力囊肿，当侵蚀卵巢组织，病灶较大，又有痛经的症状，然后引起了卵巢功能衰退时，就可能引起月经失调，导致月经稀发或者是月经频发，甚至是月经闭经等情况出现。
如果卵巢囊肿的直径超过5公分，是要做手术治疗的，因为卵巢囊肿可能引起恶变，所以要及时手术治疗。