原发性腹膜炎有可能需要手术治疗。在病情恶化并且诊断不是很明确的情况下，可以做剖腹探查手术并且同时可以做腹腔镜的引流。
在手术过程当中应该要以大量的生理盐水清洗腹腔，将腹腔内的脓液清洗干净，必要的时候有可能需要在下腹部放置引流管。
手术过程中也需要取渗出液，做渗出液的细菌培养，可以明确感染的病原微生物类型，也可以做药物的敏感试验，以便选择有效的抗生素。手术后需要采取半卧位，有利于感染局限，从而有利于病情的尽早恢复。