一部分胃肠间质瘤还是能够治好的。
对于局限性的胃肠间质瘤，主要的治疗方式就是根治性手术切除。病人在治疗之后，是有希望获得根治的。特别是一些经过评估，确认危险程度很低或低危的病人，通常可以获得5年或10年以上的长期生存。
即使是中危或高危的胃肠间质瘤，在手术切除治疗后，还可以进行伊马替尼术后辅助治疗。辅助治疗的持续时间一般要求在1~3年左右。如果手术中肿瘤发生破裂，要考虑延长辅助治疗的时间。
通过以上综合性治疗手段的应用，病人的生存期是可以延长到5年以上时间，而达到临床治愈。