对于持续性孤立性蛋白尿、蛋白尿伴显著肾脏病的患者需根据临床特征和肾脏病理类型，有针对性的制定治疗方案。
一、一般治疗：饮食控制：无症状蛋白尿患者食物中蛋白质摄入量不宜过高，同一般正常人相似即可，在无高血压和无水肿时可正常盐饮食。避免诱因：包括去除潜在感染病灶、避免感染、从事较轻工作、生活有规律，避免使用肾毒性药物等。控制伴发疾病：如糖尿病、高血压、高脂血症、高尿酸血症、冠心病等。
二、持续性孤立性蛋白尿的治疗：长期严密随访，根据蛋白尿情况可使用血管紧张素转换酶抑制剂或血管紧张素受体拮抗剂，中药汤剂或中成药等以减轻蛋白尿、保护肾功能。
三、伴有肾病蛋白尿的治疗：此类患者一般需使用血管紧张素转换酶抑制剂和血管紧张素受体拮抗剂、中药、抗凝药物等。肾脏病理改变以系膜增生性肾炎、局灶节段性肾小球肾炎、微小病变肾病、膜性肾病等为主，根据肾脏病理类型和肾组织具体病变情况，决定是否使用肾上腺糖皮质激素和免疫抑制剂。