早上咳出褐色的痰可能有以下的情况：
1.与患者有鼻部以及鼻咽部的疾病有关系。比如有真菌性鼻窦炎、鼻腔内翻乳头状瘤、鼻咽癌等疾病，病变局部血管出血，与鼻涕混杂在一起，倒流进入嗓子，可以咳出这种褐色的痰液。
2.可能与患者有咽喉部本身的疾病有关系。比如有咽喉部梅毒、结核、咽喉部恶性肿瘤，上述病变局部破溃以及局部混杂有渗出液，可以咳出褐色的痰。
3.可能与患者有支气管扩张、肺结核、肺癌等相关的肺部疾病有关系。上述疾病经常有咳血，血在空气中被氧化之后，可以咳出这种褐色的痰液。