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患者出现泌尿系感染，应当区分是上尿路感染，还是下尿路感染，是什么细菌引起的。首先要完善尿常规、尿细菌学检查还有尿白细胞的排泄率检查，同时要完善血常规、肾功能检查、血生化等检查，还有一些特殊项目的检查，如膀胱穿刺尿培养检查，还有X线检查、B超以及CT的检查，还有其他病原学体的培养及分离。 先经验性的给予抗感染治疗，以后根据药敏实验，从而指导抗生素的治疗。
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