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神经内科偏向于遗传疾病以及只需要保守治疗的疾病，比如脑血管病、癫痫、炎症和变性病等。而脑外科主要偏重于用手术治疗的疾病，比如肿瘤、癫痫、血管畸形等。 神经内科和神经外科在功能上相辅相成，缺一不可，部分疾病神内可以治，部分疾病神外可以治，还有部分疾病需要神经内科和神经外科共同治疗。
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