大便细菌培养主要是检查细菌性痢疾、伤寒、副伤寒、霍乱、食物中毒等疾病。
粪便细菌培养是利用粪便的特殊性、具体的特点，在人体肠道内会存在大量的细菌，而大肠杆菌、产气杆菌、变形杆菌等都是寄生在肠道内的细菌，不会使正常的肠道患病。
但当肠道发生生理变化时，也可能导致某些疾病。沙门氏菌、霍乱弧菌结合洁净、嗜盐菌等是常见的肠道病菌。这些菌种具有不同的特性，因此在采集处理和培养方法上有其不同的表现形式，便于鉴别。
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