咽拭子检查时，通常并不会很难受，因为咽拭子核酸检测的步骤很简单，操作的过程中，医生首先会使用压舌板将患者的舌头压平，之后要求患者发出类似于啊的声音，目的是为了让患者将咽喉部分暴露在医生面前。
同时，医生会使用干净的医用棉签，蘸取患者咽喉部位的分泌物，送到实验室去检测，这种操作时间很快，不会让病人出现过多的不适症状。
但是，患者有一部分可能会存在咽反射非常敏感的表现，在做检查时可能会出现短暂的恶心、呕吐症状，不过通常很快就会好转。
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