灰指甲可能是红色毛癣菌、须癣毛癣菌，或者念珠菌等真菌感染引起的。
1.红色毛癣菌。红色毛癣菌引起的灰指甲，一般表现为远端甲下型甲癣。病变部位主要位于指甲甲板的远端，局部的指甲逐渐浑浊，指甲的质地是比较脆弱的，容易发生断裂。随着病情的加重，灰指甲可能波及整个指甲。
2.须癣毛癣菌。须癣毛癣菌引起的灰指甲，大多属于甲板内型灰指甲。病变部位一般是比较浅的，损害局限于甲板内，会出现白色或者灰白色等改变，并没有明显增厚的症状，在甲床的皱襞处也可能有脱屑的症状。
3.念珠菌。念珠菌感染引起的灰指甲，主要表现为浅表性白色甲癣。甲板层内会出现小的浑浊点，在逐渐扩大后一般会融合成片状，可能会波及到整个指甲，指甲的硬度会变软。
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