做肛窦炎手术有可能会导致以下一些并发症：
第一，出血。肛窦炎术后引发的出血症状大多并不严重，出血量少的患者并不需要特殊的治疗，如果出血量偏大的患者可以通过使用药物或者手术缝扎等方法止血。
第二，疼痛。肛窦炎手术切口位于肛管表面，局部神经末梢分布非常丰富，所以会引发患者出现术后疼痛症状，排便时疼痛会加重。
第三，感染。术后切口有可能会出现感染，严重的会引发肛腺炎甚至肛周脓肿。
第四，肛裂。少部分肛窦炎术后的患者局部切口愈合不良，切口会形成慢性溃疡从而会导致形成肛裂。