做肠镜检查能发现以下几种肠道疾病：
首先，做肠镜检查能够发现各种类型的肠道炎症、溃疡或糜烂以及病变的部位，比如普通肠炎、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核、细菌性痢疾以及阿米巴痢疾等。如果发现肠黏膜有糜烂或溃疡，还可以取病灶处的组织做病理检查进一步明确。如果病变性质为非干酪样肉芽肿性炎，可以明确克罗恩病诊断。如果病变性质为干酪样肉芽肿，一般是肠结核导致的。
其次，肠镜检查还能发现各种类型的肠道息肉，还可以取一部分息肉组织做活检明确息肉的病理类型，之后可以根据病理性质采用不同的镜下治疗方法。
此外，肠镜检查还能发现痔疮等疾病。