胆道华支睾吸虫病的治疗是以驱虫为主，目前应用最多的是吡喹酮与阿苯哒唑。
如果胆道系统内的虫体较多，造成了胆道的梗阻，就需要通过手术来解除，如果在疾病的发展过程中造成了肝脏的损害，就会需要疏肝利胆、保护肝脏的药物，病情严重的也需要手术治疗。
在治疗过程中，是要防止再次感染，生活和饮食方面需要注意，不吃鱼及未煮熟的鱼肉或虾，改进烹调方法和饮食习惯，注意生、熟食的厨具要分开使用。
家养的猫、狗，如粪便检查阳性者应给予治疗，不要用未经煮熟的鱼、虾喂猫、狗等动物，以免引起感染，加强粪便管理，结合农业生产，清理塘泥或用药杀灭螺。