直肠息肉癌变的时间并不确定。从直肠息肉形成到发生癌变时间比较久，多数需要5~10年以上的时间，甚至更久。但目前在临床上也有5年内直肠息肉发生癌变的病例报道。
直肠息肉癌变的时间还和息肉的组织学类型直接相关，直肠腺瘤型息肉可分为绒毛状腺瘤、管状腺瘤以及管状绒毛状混合型腺瘤。其中直肠绒毛状腺瘤癌变概率最高，所以其发生癌变的时间也比较短。混合型腺瘤其次，而管状腺瘤的癌变概率最低，癌变发生的时间也是相对偏长。
无论癌变时间的长短，对于可能发生癌变的直肠腺瘤型息肉应及时行手术切除。