卵巢囊肿切除后是否影响生育要看卵巢囊肿手术方式、卵巢的功能、囊肿的性质等综合考虑。
对卵巢囊肿一侧的良性包块，行卵巢囊肿的剥除术，术后没有过多破怀卵巢组织，卵巢皮质功能还好，这种情况对生育的影响是不明显的。
对双侧卵巢囊肿，尤其巧克力囊肿，术中行囊肿切除术，本身巧克力囊肿对卵巢就有破坏作用，术后不易排卵，术后生育的机会就会有明显的影响。
对于因卵巢囊肿手术是行一侧卵巢切除，如对侧卵巢功能好，一般来说还是可以生育的，只是几乎相对减少；对于双侧卵巢囊肿切除一侧，保留一侧，因卵巢囊肿剥除术对卵巢还有影响的，生育还是会受到影响。
所以说卵巢囊肿的手术不管是囊肿剥除术还是切除术，对卵巢都是有影响的，但因女性有两个卵巢，一般影响不严重；两侧都有卵巢囊肿的对生育的影响就会更明显，有些卵巢囊肿会直接影响生育，导致不孕。