卵巢囊肿有些会影响女人生育，有些对生育也没有明显的影响。
比如一些比较小的生理性的卵巢囊肿，对生育一般就不会有什么影响。但是如果卵巢囊肿比较大，就会影响卵巢的分泌功能，会影响优势卵泡的发育、会影响排卵，有些还会影响输卵管的功能，所以对女人生育会产生比较大的影响。对一些比较大的卵巢囊肿，又有生育要求，一般还是建议先进行卵巢囊肿的剥除，再备孕。如果卵巢囊肿持续存在，有可能会影响生育。有些卵巢囊肿如果出现蒂扭转，就会影响输卵管的功能，甚至有些扭转会导致输卵管的坏死，需要切除输卵管。所以尽早剥除卵巢囊肿，对生育还是有好处的。
但是如果卵巢囊肿比较小，有可能是生理性的，就可以定期随访观察。