胃黄斑瘤的病因尚未完全明确，不少学者认为与环境因素、黏膜的慢性炎症、幽门螺旋杆菌感染、脂质代谢异常、自身免疫机制等多种因素有关。
胃黄斑瘤是发生在胃黏膜的比较罕见的良性疾病，是由于脂质沉积所致。经常处于受到污染的环境，是诱发胃黄斑瘤的一个诱因。胃黏膜慢性的炎症，例如萎缩性胃炎，会造成脂质代谢运转出现障碍，大量的脂质沉积从而诱发该病。
胃蠕动造成局部物理、酸性环境的化学刺激，造成泡沫细胞形成，也可引起胃黄斑瘤。幽门螺旋杆菌感染、桥本甲状腺炎也容易诱发此病。